백업을 위해서라면 동일한 디스크는 위헙한 선택입니다.
별도의 디스크가 자연스러운 선택이고, 장비 자체의 문제나 노트북의 분실에서 외장 디스크가 유리하겠군요.
고가의 별도 솔루션이 더 많은 기능을 제공하거나 더 많은 플랫폼을 지원하겠습니다만, 가격과 편의성이 문젭니다. 선택적인 복구를 매력적으로 포장한 타임캡슐이 802.11n과 함께 온다는게 끌리는 점입니다.
angelina님의 경우에는 CVS나 Subversion 같은 방법도 고려해보시면 어떨까 싶습니다.
이전의 파일과 함께 수정사항과 내역을 주석과 함께 관리할 수도 있거든요.
비교적 간단한 시스템이고, 서버 자체는 며칠에 한번씩 백업하면 괜찮을겁니다.