말씀해주신 프로그램들 중에 sequencher라는 프로그램이 상당히 매력적으로 여겨집니다.
물론 sequencing file과 원 sequence file을 align으로 분석하는 방법도 있지만
전용으로 사용할 수 있다는 점이 편리할것 같다는 생각이 많이 드네요.
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Sequencher 가 아주 유용한 것은 사실입니다.. PC 용과 Mac OS X용을 모두 지원하는 점도 아주 좋구요..
라이센스가 없으시다면..(라이센스라기 보다. 이걸 구동하기 위한 KeyAccess가 되어야 합니다. 이게 문제죠..) 데모로 사용해 보시길..
굳이 시퀀스 확인만 하고 그걸 저장하실 이유가 없다면(보통 확인하면 적어 두시면 끝이지요.) 데모로도 충분한 것 같더군요..
http://www.genecodes.com/sequencher/
웹사이트입니다. 한번 사용해 보세요..